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黄连耐寒，喜高寒冷凉气候条件，不耐炎热，在霜雪下叶片能保持常绿不枯。产区雨雪较多，冬季常在黄连叶上覆盖一层冰雪，对黄连起到保护作用，故在较低的气温条件下也能正常越冬。重庆主产区石柱县黄水地区11月至次年1月，气温低于5℃，植株处于休眠状态，在-6℃时 ，叶能保持常绿。2月上旬至中旬，平均气温为0.23℃，为花薹出土期，若遇-10℃以下的低温，则花薹出现萎蔫。2月中旬至3月上旬，气温2.2℃~7.5℃时，为开花期，随着温度的升高，开花期可提前和缩短。未开花的植株在5℃以上时，开始发生新叶，10℃时，新叶生长加快，在25℃以上时，新叶生长缓慢。
黄连亩产量一般在100-300公斤，此外黄连须根亩产量约占总产量的30%左右，小檗碱含量在5%左右，是仅次于根茎的产品。其他如黄连叶、黄连渣等均可作兽药用。
黄连一般种植4-5年即可采挖，最长不宜超过6年，分延长生长期则黄连生长势减弱，根茎易腐烂，品质差，产量下降。
现代药理研究，黄连有解热、抗炎、抗菌、抗心律失常、降压、正性肌力作用，有利胆、抑制胃酸分泌、抗腹泻等作用，有抗急性炎症、抗癌、抑制组织代谢及抗溃疡等作用。
黄连素是一种重要的生物碱，是我国应用很久的中药。可从黄连、黄柏、三颗针等植物中提取。它具有显著的抑菌作用。常用的盐酸黄连素又叫盐酸小檗碱，其化学结构如图所示。黄连素能对抗病原微生物，对多种细菌如痢疾杆菌、结核杆菌、肺炎球菌、伤寒杆菌及白喉杆菌等都有抑制作用，其中对痢疾杆菌作用最强，常用来治疗细菌性胃肠炎、痢疾等消化道疾病。临床主要用于治疗细菌性痢疾和肠胃炎，
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